Manisa’yı Romalılardan alan Saruhan Bey’in torunudur. Muzafferiddîn İshak Çelebi, Saruhan Bey’in oğlu İlyas Bey’in oğludur. İlyas Bey’in ölümünden sonra mîlâdî 1364 yılında beyliğin başına oğlu İshak Bey geçti. Babasının sağlığında Menemen’de sancak beyliği yapmıştır. İshak Bey’in Çelebi unvanını, anne tarafından Mevlânâ sülalesinden olduğu ve Mevlevi Tarikatı’na mensup olduğu için aldığı iddia edilmektedir. İnşa ettirdiği Mevlevihane ile Manisa’da Mevleviliğin arttığı da anlaşılabilir. Sultan ve Han unvanlarını kullanmıştır. Saruhanoğulları beyinin başına geçtiğinde beylik en zayıf bir zamanda olmasa da onun zamanında Saruhanoğulları en parlak devrini yaşadı.

İshak Çelebi, hayra, ilme ve îmâra çok önem vermiştir. Onun Hacı Emet bin Osman’a hicrî 768 (mîlâdî 1369)’da yaptırmış olduğu Ulu Câmiî, hicrî 780 (mîlâdî 1378)’de yaptırdığı Ulu Câmiî (İshâkiyye-i Fethiyye) medresesi ve hicrî 770 (mîlâdî 1369)’da yaptırdığı Mevlevihâne yapıları, Manisa için önemli olduğu kadar da Türk-İslâm sanatı için de önemli yapılardır. İshak Çelebi vakfiyesinden anlaşıldığına göre, en çok hayır yaptıran Bey’dir. Aynı zamanda Mevlevî şeyhlerinden olduğu bilinmektedir.